雖然CE認證標志是生產商的責任，但是如果廠家自行在產品上加貼CE認證標志，其在市場開拓活動中會遭遇很多困難，尤其當發生了產品或商務糾紛時，其后果不堪設想。所以，為降低風險，通常生產商會請第三方CE認證機構幫助進行測試，驗證產品的符合性，并出具證明文件。尤其是CE認證指令中規定的高危險產品，必須由公告機構(NOTIFIED BODY)簽發證明。

歐盟各國都有專門的檢查機構，通過各種途徑對歐盟市場上流通的產品進行檢查，一旦發現產品不符合歐盟CE認證指令的要求，進口商或制造商都會受到嚴厲的處罰，法律起訴的責任罰款可以高達數千萬歐元。一般國內的企業很少直接按照歐洲CE認證標準進行生產，對協調標準的具體要求也不甚清楚。